Pada Sabtu (19/4) sore, proses evakuasi Commuter Line Bogor No. 1040 relasi Manggarai-Bogor yang tertabrak kendaraan roda empat di perlintasan sebidang JPL No. 27 lintas Cilebut-Bogor telah selesai dilakukan. Roda KRL yang anjlok berhasil kembali ke posisi rel pada pukul 21.29 WIB. Setelah itu, pukul 21.56 WIB, KRL tersebut dijalankan menuju Depo Depok untuk diperiksa dan diperbaiki. VP Corporate Secretary KAI Commuter, Joni Martinus, menyatakan bahwa evaluasi dilakukan lebih cepat dari perkiraan awal.
Petugas di lapangan juga masih bersiaga dan melakukan normalisasi jalur rel untuk menjamin keselamatan perjalanan kereta api. Dugaan sementara menyebutkan bahwa pengemudi kendaraan mungkin menerobos palang pintu perlintasan sehingga terjadi insiden di tengah perlintasan. Namun, KAI Commuter akan berkoordinasi dengan pihak berwenang untuk investigasi lebih lanjut.
KAI Commuter terus mengimbau kepada pengguna jalan raya untuk selalu tertib saat melintas di perlintasan, dengan memberikan prioritas pada perjalanan kereta api. Akibat kendala operasional ini, KAI Commuter melakukan pembatasan perjalanan pada 16 Commuter Line Bogor. Mereka juga mengingatkan pengguna Commuter Line untuk selalu mematuhi aturan dan arahan petugas di lapangan, serta menjaga keselamatan selama perjalanan.